肝膽外科常規開展肝癌、膽管癌、肝門部膽管癌、膽囊癌、胰腺癌、復雜肝內外膽道結石、重癥胰腺炎、門脈高壓癥等的診治，常規開展肝葉段切除術、膽囊癌根治術、胰十二指腸切除術、保留脾臟胰腺體尾部切除術、巨脾切除術、脾切+斷流術、腹腔鏡肝切除術、先天性膽總管囊腫切除RUO-EN-Y膽腸吻合術等手術。
血管外科創建于2014年，獨立成科于2020年，以血管腔內微創介入治療和血管開放手術為專科特長，血管外科作為全國靜脈疾病規范化診療中心省級示范中心、昆山市靜脈血栓防治聯盟主席單位、昆山市靜脈血栓防治基地，承擔昆山市靜脈血栓栓塞疾病的診治工作。尤其在主動脈夾層、胸腹主動脈瘤破裂、頸總動脈橫斷、頸靜脈破裂、肺栓塞等血管外科危重患者的搶救方面具備強大實力。
胃腸外科創建于2007年，2017年獨立病區。以腹腔鏡微創手術為特色，常規開展腹腔鏡下胃癌根治術、腹腔鏡下結直腸癌根治術、超低位直腸癌保肛手術（ISR）等先進術式，并積極開展覆蓋全部胃腸腫瘤患者的多學科診療（MDT），探索胃腸道腫瘤的雙鏡聯合治療。
肛腸外科創建于2002年。科室常規開展：腸鏡檢查；結、直腸癌根治術（含腹腔鏡）；極限保肛術，如超低位直腸癌精準功能保肛術（PPS）；各類痔病、肛周膿腫、肛瘺及肛裂的微創治療，如各類吻合器痔切除術、超聲引導下痔血管縫**，內痔套**，內痔硬化劑注射治療術，內鏡下內痔套**，括約肌間瘺管結**（LIFT），肛瘺鏡治療肛瘺等；結腸水療，肛門直腸測壓，盆底生物反饋治療，炎癥性腸病中西醫結合治療。
甲乳外科常規開展乳腺癌、乳腺增生、乳頭溢液、漿細胞性乳腺炎、副乳房、甲狀腺良、惡性腫瘤等乳腺、甲狀腺疾病的規范診治，對乳腺病損切除、乳腺膿腫切開、乳腺癌改良根治、甲狀腺腺瘤切除、頸部淋巴結清掃等技術有較深的造詣。在外科治療的基礎上，與多學科開展密切合作，是目前昆山市唯一具備精準策略化醫療的甲狀腺疾病、乳腺疾病一站式服務中心。
急診外科致力于外科急腹癥、胸腹部創傷的救治工作，開展普外科急診手術，特別是對梗阻性腸病、腸瘺、晚期胃腸腫瘤并發癥、重癥胰腺炎、膽石癥、消化道穿孔、多發傷等外科急危重癥患者形成規范的救治流程，提高危重患者的救治成功率。
